Сначала надо убрать фекалии и остатки пищи.
Я бы взял для этого кусок синтепона, сложил бы его в несколько раз и полученный мат уложил плотненько в первый отсек. Или использовал стандартную поролоновую мочалку (что мне меньше нравится).
Затем надо убрать то из вышеперечисленого, что не задержал первый отсек.
Я бы взял для этого кусок синтепона, сложил бы его в несколько раз и полученный мат уложил еще плотнее во второй отсек.
А теперь надо убрать то, что проскочило через 1-й и 2-й отсеки.
Я бы взял для этого цеолит или активированый уголь.
Различные наполнители для биофильтрации я бы не ставил, так как в предложеном варианте фильтра от них мало проку.
Вообще-то я так черепах не держу. Передо мной нет декоративных задач, так что я предпочитаю решать вопрос тотальными заменами воды.